Artículo 16. La Junta Directiva es el órgano supremo de gobierno del CONACOFI y estará integrada por:
I. Un presidente;
II. Un secretario ejecutivo, que estará a cargo del Director General de Sanidad Vegetal del SENASICA;
III. Un secretario técnico;
IV. Un representante de la Secretaría;
V. Un representante de la Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales;
VI. Un representante de la Secretaría de Economía;
VII. Un representante de la Secretaría de Salud, y
VIII. Las vocalías, las cuales serán determinadas por los demás miembros de la Junta Directiva en función del número de representantes y personas conforme a lo establecido en el artículo 17 de la Ley.
El presidente y el secretario técnico serán nombrados de entre los miembros de la Junta Directiva por dichos miembros y durarán en su cargo un periodo de tres años, pudiendo ser reelectos por el mismo periodo y por una sola ocasión. Los representantes de las Secretarías no podrán ejercer estos cargos.